高新技术企业认定要求的专项审计，指的是注册会计师对申报企业的研究开发费用和高新技术产品(服务)收入发表审计意见，出具审计报告。
专项审计报告内容
（一）近一个会计年度高新技术产品(服务)收入，内容包括：
1、高新技术产品(服务)收入明细；
2、技术性收入包括了技术转让收入、技术承包收入、技术服务收入、接受委托科研收入等内容；
3、高新技术产品(服务)收入与技术性收入之和；
4、高新技术产品(服务)收入与技术性收入之和占企业当年总收入的比例。
企业在申报国家高新技术企业认证前准备好各年的高新技术产品收入明细表，每一年都要按不同的产品类别列表，区分发生时间、凭证号、内容和金额等以及对应的重要销售发票复印件和与收入有关的合同复印件。
（二）近三个会计年度的研发费用分年度分项审计，内容包括：
1、近三个会计年度的研发总费用、在中国境内发生的研究开发费用总额;
2、近三个会计年度的研究开发费用总额占销售收入总额的比例;
3、研究开发经费及分年度分项明细。
高新技术企业专项审计报告要点
1、依据国家高新技术企业认定标准，研究开发经费专项审计报告需要是近三年内的（经营不满三年的按实际年度）；高新技术产品（服务）专项审计报告为近一年内。
2、专审需要会计师事务所盖公章、注册会计师签名。
3、出具专审报告的会计师（税务师）事务所需要符合资质要求：成立三年以上证明以及注册会计师或税务师人数占比不低于30%的证明。
4、附有会计事务所营业执照复印件、执业证书复印件。
5、有研发活动费用归集范围及来源说明。
6、境内研发费用占总研发费用比例为大于60%。
7、研发费用总额占销售收入总额比例达国家高新技术企业申报规定：最近一年销售收入小于5000万元（含）的不低于5%；5000万元至2亿元（含）的不低于4%；2亿元以上的企业，比例不低于3%。
8、高新技术产品证明。
9、总收入=近一年年度财务审计报告和纳税申报表中主营业务收入+其他业务收入+营业外收入+投资收益+不征税收入。
10、高新技术产品（服务）收入占近一年总收入比例大于60%。
专项审计报告最新规定
1、研发费用数据保持一致性
高新技术企业认定要求企业提交的研发费用必须保持“三表一致”，三表指的是所得税纳税申报表、企业财务报表，还有研发费用专项审计报告，且三个表中的研发费用数据要符合高新技术企业的认定条件。
2、高新技术产品须有证明材料
企业提交的高新产品资料中（或者服务），须有合同、发票以及相应的知识产权证明。