1.高新技术企业资格认定不再设有复审环节;
2.申请高新技术认定的企业，提交的申请资料中新增“近一个会计年度高新技术产品(服务)收入专项审计或鉴证报告”以及“近三个会计年度企业所得税年度纳税申报表”;
3.审查认定的公示时间由15个工作日减少至10个工作日，提高行政效率;
4.进一步明确税收优惠享受的起止时间:
(1)起始时间:
企业获得高新技术企业资格后，自高新技术企业证书颁发之日所在年度起享受税收优惠;
(2)终止时间:
对已认定的高新技术企业，经复核被认定为不符合高新技术企业条件而被取消高新资格的，税务机关将追缴其不符合认定条件年度起已享受的税收优惠对于已认定的高新技术企业，因弄虚作假、违法违规、未按规定履行报告义务面被取消高新资格的，税务机关可追缴其自发生上述行为之日所属年度起已享受的高新技术企业税收优惠。另32号文件取消了172号文件中“认定机构在5年内不再受理该企业认定申请”的规定。
5.明确高新技术企业的自主报告事项:
(1)企业获得高新技术企业资格后，应于每年5月底前在“高新技术企业认定管理工作网”填报上一年度知识产权、科技人员、研发费用、经营收入等年度发展情况报表;
(2)高新技术企业发生更名或与认定条件有关的重大变化(如分立、合并重组以及经营业务发生变化等)应在三个月内向认定机构报告。172号文件曾规定发生上述情况时，需于15日内向认定机构报告，32号文件报告时限放宽更有利于纳税人。
(3)新增“未按期报告与认定条件有关重大变化情况，或累计两年未填报年度发展情况报表的，将被取消高新资格。”
6.新增高新技术企业跨认定机构管理区域搬迁时，高新资格的延续问题:
(1)企业于高新资格有效期内完成整体迁移的，资格继续有效;
(2)企业部分搬迁的，由迁入地认定机构重新认定;
(3)企业超过高新资格有效期进行整体迁移，32号文件对相关资格延续问题未子明确，实际操作中，应由迁入地认定机构重新进行高新资格认定。
7.企业存在偷、骗税行为的，不再作为取消高新技术资格的情形之一。
申请时需要提交以下8项材料：
1.高新技术企业认定申请书;
2.证明企业依法成立的相关注册登记证件;
3.知识产权相关材料、科研项目立项证明、科技成果转化、研究开发的组织管理等相关材料;
4、企业高新技术产品(服务)的关键技术和技术指标、生产批文、认证认可和相关资质证书、产品质量检验报告等相关材料;
5.企业职工和科技人员情况说明材料;
6.经具有资质的中介机构出具的企业近三个会计年度研究开发费用和近-个会计年度高新技术产品(服务)收入专项审计或鉴证报告，并附研究开发活动说明材料;
7.经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度的财务会计报告(包括会计报表、会计报表附注和财务情况说明书);8.近三个会计年度企业所得税年度纳税申报表。