（一）所得税率优惠。高新企业享受15%的优惠所得税率，相当于在原来25%的基础上降低了40%。
（二）“两免三减半”（取消）。原深圳特区以内，2008年1月1日以后成立的企业自取得第一笔生产经营收入所属纳税年度起，第一年至第二年免征企业所得税，第三年至第五年按照25%的法定税率减半征收企业所得税。
（三）人才安居购房补贴。高新技术企业可以推荐一位本公司的深圳高层次人才申请奖励补贴，补贴标准为：龙华新区224W（40%配套），宝安区320W（100%配套），其他区域均160W。
（四）高新技术企业符合条件的技术转让所得免征、减征企业所得税。一个纳税年度内，居民企业技术转让所得不超过500万元的部分，免征企业所得税；超过500万元的部分，减半征收企业所得税。
（五）高新技术企业固定资产加速折旧。允许加速折旧的固定资产包括：1、由于技术进步，产品更新换代较快的固定资产；2、常年处于强震动、高腐蚀状态的固定资产。采取缩短折旧年限方法的，最低折旧年限不得低于本条例第六十条规定折旧年限的60%；采取加速折旧方法的，可以采取双倍余额递减法或者年数总和法。
（六）研发费用加计扣除。企业为开发新技术、新产品、新工艺发生的研究开发费用，未形成无形资产计入当期损益的，在按照规定据实扣除的基础上，按照企业研究开发费用的50%加计扣除；形成无形资产的，按照无形资产成本的150%摊销。
深圳市每年从债券发行总额中拨出20%的额度给符合发行条件的高新技术企业
（七）在2008-2020年，深圳将建成500万－600万平方米创新型产业用房，支持高新技术产业发展。
（八）高新技术企业认定将有效地提高企业的科技研发管理水平，重视科技研发，提高企业核心竞争力，能为企业在市场竞争中提供有力的资质，极大地提升企业品牌形象，无论是广告宣传还是产品招投标工程，都将有非常大的帮助。
（九）高新技术企业对于任何企业都是一个难得的国家级的资质认证，对依靠科技立身的企业更是不可或缺的硬招牌，其品牌影响力仅次于中国名牌产品、中国驰名商标、国家免检产品。
（十）取得国家高新技术企业证书后可享受各区相应认定补贴，如：深圳市直接奖励5万元，重新认定3万元，龙华新区（高新复审10万）、龙岗（高新复审10万）各20万，南山区10万,福田区20万（高新复审5万）,光明新区、宝安（复审10万）、罗湖、坪山、盐田30万。
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